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基于比较转录组学分析揭示中华蜜蜂及意大利蜜蜂幼虫的球囊菌抗性差异机制


澳门新葡亰平台官网   发布时间: 2019-05-20   信息员:  


基于比较转录组学分析揭示中华蜜蜂及意大利蜜蜂幼虫的球囊菌抗性差异机制.pdf


编辑熊翠玲,,王鸿权,郑燕珍,付中民,王海朋,,陈大福,*


摘要:为探究中华蜜蜂(Apis ceranacerana)与意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica)幼虫的球囊菌抗性差异产生的原因,利用Venn分析、GO分类分析、KEGG代谢通路分析以及Ka/ks分析对二者的转录组进行比较研究。Venn分析结果显示,中蜂与意蜂的同源基因有17 656 个,归属于8 111 个基因家族,二者的特有基因分别有1 158241 个,分别归属于46886 个基因家族。GO分类结果显示,中蜂和意蜂的特有基因分别富集在3828 GO条目。KEGG代谢通路富集分析结果显示,中蜂和意蜂的特有基因分别富集于9621 个代谢通路;进一步分析发现中蜂的特有基因富集在内吞作用、溶酶体、泛素介导的蛋白水解和黑化作用等4 个细胞免疫通路,以及MAPK信号通路和Toll-like受体信号通路等2 个体液免疫通路,而意蜂仅有1 个特有基因富集在MAPK信号通路。Ka/Ks分析结果显示受到强烈正向选择、弱正向选择、中性选择和负向选择的单拷贝同源基因分别有372812 6303 269 个。对受到强烈正向选择的基因进行GO分类和KEGG代谢通路富集分析,GO结果显示中蜂和意蜂的单拷贝同源基因富集的GO 条目类型相同;KEGG结果显示中蜂的单拷贝基因仅富集在氧化磷酸化。上述结果表明免疫相关基因数量的差异是二者的球囊菌抗性差异产生的重要原因之一,中蜂在与球囊菌的协同进化过程中可能通过提高能量利用从而限制球囊菌的增殖。本研究结果可为阐明中蜂及意蜂幼虫的球囊菌抗性差异产生的分子机制提供参考。


关键词: 中华蜜蜂;意大利蜜蜂;幼虫;比较转录组学;球囊菌


发表信息:中国农业大学学报,2019,245):106-114

  


 
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